Nemzeti parkok

Indonéziában 51 nemzeti parkot tartanak számon, amelyből hat világörökségi helyszín.

Jáva szigetén 12 nemzeti park található. Néhány ismertebb nemzeti park.

Megnevezés: Létrehozás éve: Terület: Leírás:
Alas Purvo 1992 432 km2 Blanbangan szigeten található. Kelet-Jáva délkeleti csúcsán. Nemzeti parkban található a Mount Linggamanis (332m) hegycsúcsa.

Védett állatok: banteng ( vad szarvasmarha),jávai langúr, zöld páva, bankivatyúk, zöld teknős

Védett növényzet: Terminalia catappa , Calophyllum inophyllum , Sterculia foetida , Barringtonia asiatica és Manilkara kauki

Márciustól – novemberig szörfösök paradicsoma.

Baluran 1980 250 km2 Jellemzően száraz éghajlatú, gyér növényzettel rendelkező vidék. Legmagasabb pontja: Baluran-hegység (1224m)

Veszélyeztetett fajok: jávai leopárd, indiai muntyákszarvas, jávai egérszarvas, halászmacska, indiai marabú.

Bateng állomány jelentős csökkenése tapasztalható. Az utolsó jávai tigrisek 1960-ig éltek a területen.  A sok mocsaras terület veszélyt jelent a bateng-állomány túlélésében. A nemzeti parkot évente több, mint 10 ezer látogató tekinti meg.

Bromo Tengger Semeru 1983 503 km2 Vulkáni hegyek által ölelt mencék jellemzik. Egy részét homoktenger borítja. Legmagasabb pontja : Mount Semeru (3676 m)

A parkban és környékén a Tengger nép lakik. Java szigetén maradt néhány jelentős hindu közösség egyike. A mintegy 600 000 lakosuk harminc faluban található az elszigetelt Tengger hegyeiben. A tengeri homok megőrzésén túl cél a gazdag flóra és fauna megőrzése.
Védett fajok: ritka bükkfafélék, eperfafélék,kuzárfa, ritka solyómfélék, sörényes szarvas, szumátrai vadkutya, márványfoltos macska, jávai leopárd, közönséges makákó.

Gunung Ciremai 2004 155 km2 Ciberon városától 50 km-re délre fekszik, Nyugat-Szumátrán. Védett fajok: szumátrai fenyő, jávai gesztenye, macaranga, leopárd, muntyákszarvas, jávai sólyom és különféle piton fajok. 

Legmagasabb pontja: Mount Ceremai (3078 m)

Mount Gede Pangrango Nemzeti Park 1980 152 km2 Mount Gede (2 958 m) és a Pangrango (3,019 m) két vulkáni hegy is található a nemzeti parkban. Gyors folyású hegyi patakok övezik a területet. Több, mint 450 féle madárfaj található meg, köztük olyan ritka fajokkal, mint a jávai sólyom és a jávai bagoly. 1977 óta az UNESCO bioszféra rezervátumnak nyilvánította.

Olyan ritka fajok védelmét őrzik itt, mint az ezüst gibbon, jávai leopárd, leopárdmacska, maláj tarajos sül.

Gunung Halimun Salak 1992 400 km2 Salak-hegyet és a Halimun-hegyet magába foglaló nemzeti park. Ködös hegycsúcsai elérik az 1929 m-t, Mount Salak nagyon csapadékos és jelentős vízgyűjtő terület. A területen él a Kesepuhan 5.300 főt tartalmazó hagyományőrző közösség.150 faj található meg a parkban. Védett fajok: ezüst gibbon, jávai sólyom, jávai leopárd.
Gunung Merapi 2004 64 km2 Merapi (2930 m) vulkáni kúpját övező természetvédelmi terület. Aktív vulkáni tevékenység jellemzi (2006,2010,2018 kitörés)
Gunung Merbabu 2004 57 km2 Merapi-hegy közvetlen közelében lévő, Saragita városa közelében helyezkedik el.  Merabu-hegy (3145 m) vulkáni kúpja menténk kialakított természetvédelmi terület.
Karimunjawa 1986 1116 km2 80 km-re helyezkedik el Jeparától. Fehér homokos strandot, korallzátonyokat is magában foglalja. Védett fekete korall, közel 250 fajta díszhalakkal. Fokozottan védett tengeri fajok: szarvas sisakcsiga, Triton tengeri csiga, számos polip és csigafaj. Kemujan-sziget mellett 1955-ben elsüllyedt Indoro nevű panamai hajó népszerű búvárhelyszín.
Kepulauan Seribu 1982 1080 km2 342 kisebb szigetből álló hatalmas kiterjedésű tengeri természetvédelmi terület. A természet védett értékei a nagy kiterjedésű korallzátonyok és tengeri teknősök. A part mentén sűrű mangrove-erdők húzódnak, amelyben varánuszok és kígyók sok fajtája található meg.
Meru Betiri 1982 580 km2 Kelet-Jáván található, amely 8,45 km2 tengeri területet is magában foglal. Természetvédelmi terület 29 emlős és 180 madárfajt foglal magába. Megtalálható itt: batang, vaddisznó, leopárdmacska, jávai repülőmókus, zöld páva, tengeri teknősfajok. Jávai tigris, mint a kihalás szélén álló ragadozó  kis számban megtalálható a térségben. Védelem alatt áll a tengerparti, mocsári növényzet, gazdag mangrove erdőivel.
Ujung Kulon 1992 1206 km2 Jáva legnyugatibb csúcsán található nemzeti park Krakatau és Lampung tartományban helyezkedik el, melyhez hozzátartozik Panaitan a környező kis szigetekkel. A Krakatau vulkáni kitörései miatt mintegy 30 cm vastag réteghamu borítja a terület jelentős részét. A kritikusan veszélyeztetett jávai orrszarvú utolsó menedéke. A jávai tigrisek 1960-ig éltek a területen. 57 növény, 35 emlős, 72 hüllő és kétéltű és 240 madár faj él a területen. Olyan nagytestű hüllők  otthona, mint a szunda-krokodil vagy a bordás krokodil.